More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10500 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  995    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  35.39 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  37.13 
 
 		 440 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  32.99 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  33.48 
 
 		 497 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  31.67 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  34.53 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  30.92 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.83 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  29.4 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.48 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  31.45 
 
 		 490 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  31.88 
 
 		 489 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  30.7 
 
 		 493 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.45 
 
 		 510 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  29.5 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.6 
 
 		 507 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.6 
 
 		 507 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04480  carboxypeptidase s precursor, putative  27.81 
 
 		 587 aa  163  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0506615  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  27.57 
 
 		 591 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.17 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34371  Gly-X carboxypeptidase  23.54 
 
 		 582 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02910  Gly-X carboxypeptidase, putative  26.51 
 
 		 573 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10986  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 564 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  26.54 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  26.46 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  26.08 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.11 
 
 		 457 aa  115  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  26.85 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06270  carboxypeptidase s precursor, putative  24.9 
 
 		 602 aa  111  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01640  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 660 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  26.67 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  27.63 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  25.55 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  27.34 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  26.19 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  26.09 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28659  predicted protein  26.1 
 
 		 600 aa  104  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  27.23 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  24.03 
 
 		 581 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  25.06 
 
 		 472 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  24.35 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  24.72 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  24.78 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  28.03 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  24.5 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  25.69 
 
 		 443 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  25.13 
 
 		 446 aa  90.9  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  26.52 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  24.68 
 
 		 444 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  25.81 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  24.48 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  24.02 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  25.38 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  24.45 
 
 		 438 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  24.62 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  23.1 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  23.33 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  25.58 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  26.21 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  25.76 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.55 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  23.63 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  23.31 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  23.04 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  24.4 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  23.39 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  23.54 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  23.08 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.67 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  23.62 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  23.97 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  25.2 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  24.63 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  21.69 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0078  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.59 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  23.04 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.63 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.53 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.21 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  24.03 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  24.31 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  23.24 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.67 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.77 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  23.76 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  24.04 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.85 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0061  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.250429  normal  0.531249 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  23.19 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  23.72 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>