More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05470 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_05470  peptide chain release factor 2  100 
 
 
364 aa  756    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  66.01 
 
 
369 aa  497  1e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1999  peptide chain release factor 2  69.72 
 
 
364 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.285694  hitchhiker  0.0000104835 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  57.85 
 
 
369 aa  442  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  48.73 
 
 
366 aa  351  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 
372 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  45.83 
 
 
383 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  46.99 
 
 
364 aa  335  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  43.8 
 
 
367 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  46.26 
 
 
374 aa  329  4e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  45.86 
 
 
364 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  47.38 
 
 
332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  44.76 
 
 
371 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  50.16 
 
 
369 aa  324  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  45.09 
 
 
372 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  41.09 
 
 
366 aa  322  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.78 
 
 
357 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  43.77 
 
 
377 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  42.57 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  44.85 
 
 
378 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  42.57 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  43.79 
 
 
367 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  46.45 
 
 
367 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  45.98 
 
 
365 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  43.02 
 
 
372 aa  317  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  42.72 
 
 
367 aa  317  2e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  41.62 
 
 
367 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  43.6 
 
 
373 aa  315  6e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 
365 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 
365 aa  315  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 
365 aa  315  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  46.59 
 
 
365 aa  315  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  45.81 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  41.87 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  46.31 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 
349 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  44.1 
 
 
369 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  41.53 
 
 
380 aa  311  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  41.53 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  46.57 
 
 
349 aa  311  1e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  44.75 
 
 
372 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  41.24 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  44.83 
 
 
365 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  41.53 
 
 
380 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  47.06 
 
 
332 aa  310  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  44.85 
 
 
372 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  46.73 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  41.99 
 
 
375 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  44.28 
 
 
367 aa  309  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 
371 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  44.54 
 
 
371 aa  308  9e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  41.88 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  49.06 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  44.83 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  42.18 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  45.28 
 
 
371 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  45.27 
 
 
365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  45.71 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  43.37 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  44.64 
 
 
369 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 
369 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  45.4 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  43.6 
 
 
378 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
354 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  44.98 
 
 
340 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  44.7 
 
 
373 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  41.52 
 
 
362 aa  300  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  42.34 
 
 
367 aa  299  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  43.77 
 
 
371 aa  299  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  43.35 
 
 
368 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 
373 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  42.99 
 
 
327 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  44.25 
 
 
371 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  40.55 
 
 
373 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  47.06 
 
 
330 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  45.9 
 
 
364 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  43.39 
 
 
365 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  43.93 
 
 
369 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  41.18 
 
 
356 aa  296  5e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1102  peptide chain release factor 2  42.25 
 
 
337 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.437069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  43.3 
 
 
367 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0020  peptide chain release factor 2  42.68 
 
 
375 aa  295  7e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00724435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  39.39 
 
 
369 aa  295  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  43.26 
 
 
326 aa  295  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  43.26 
 
 
326 aa  295  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  45.57 
 
 
332 aa  295  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  43.26 
 
 
326 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  41.72 
 
 
332 aa  295  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  44.41 
 
 
330 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  40.06 
 
 
371 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  42.77 
 
 
371 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 
367 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  41.92 
 
 
369 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  46.22 
 
 
347 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  44.48 
 
 
367 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  43.92 
 
 
343 aa  293  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  44.67 
 
 
372 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>