More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1048 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1048  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  688    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2832  peptide chain release factor 2  63.55 
 
 
358 aa  434  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.909356  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1899  peptide chain release factor 2  56.1 
 
 
367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5751  hypothetical protein  57.93 
 
 
358 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3994  peptide chain release factor 2  57.72 
 
 
357 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0498322  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5492  peptide chain release factor 2  55.14 
 
 
362 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0496262 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09203  putative peptide chain release factor  55.08 
 
 
316 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.165955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0282  hypothetical protein  52.32 
 
 
357 aa  359  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1305  LigA  50.46 
 
 
371 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2553  peptide chain release factor 2  60.57 
 
 
254 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  50.31 
 
 
383 aa  328  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  47.88 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 
367 aa  325  5e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  49.23 
 
 
332 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.9 
 
 
367 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  48.94 
 
 
361 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  49.69 
 
 
371 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2538  peptide chain release factor 2  47.76 
 
 
363 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0366  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
332 aa  322  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2784  peptide chain release factor 2  46.27 
 
 
363 aa  322  8e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.785261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  48.45 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2031  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 
363 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0138456  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  47.43 
 
 
364 aa  318  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1057  peptide chain release factor 2  47.34 
 
 
365 aa  316  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  47.29 
 
 
371 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  45.37 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 
367 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  46.67 
 
 
364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0245  peptide chain release factor 2  48.75 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5351  peptide chain release factor 2  46.15 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0184  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 
372 aa  311  6.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5651  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 
380 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0587322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.11 
 
 
365 aa  311  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0238  peptide chain release factor 2  46.75 
 
 
363 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000385966  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5276  peptide chain release factor 2  45.85 
 
 
380 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.438705 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  47.19 
 
 
377 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0209  peptide chain release factor 2  45.51 
 
 
381 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0795  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3725  peptide chain release factor 2  47 
 
 
327 aa  309  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  46.71 
 
 
375 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  48.17 
 
 
364 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  46.91 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0778  peptide chain release factor 2  48.12 
 
 
331 aa  308  8e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  48.33 
 
 
367 aa  308  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5037  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 
326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4867  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4882  peptide chain release factor 2  45.79 
 
 
326 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  47.5 
 
 
368 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.56 
 
 
373 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  46.69 
 
 
372 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.85 
 
 
367 aa  306  3e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  53.58 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  47.73 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  44.11 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  45.14 
 
 
391 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  46.18 
 
 
379 aa  305  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  47.29 
 
 
340 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  53.58 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  54.02 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  47.5 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  45.65 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  47.98 
 
 
402 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  46.25 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  45.14 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4980  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0421  peptide chain release factor 2  47.27 
 
 
371 aa  302  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  45.94 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0023  peptide chain release factor 2  46.23 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  45.96 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  45.96 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0554  peptide chain release factor 2  47.01 
 
 
372 aa  302  5.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0168531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3429  peptide chain release factor 2  45.62 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.17 
 
 
366 aa  301  8.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  46.95 
 
 
344 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  46.18 
 
 
362 aa  301  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  54.62 
 
 
322 aa  301  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  45.32 
 
 
357 aa  301  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  45.62 
 
 
365 aa  301  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  46.39 
 
 
325 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  47.96 
 
 
330 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  47.37 
 
 
331 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  47.35 
 
 
330 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  46.11 
 
 
365 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1216  peptide chain release factor 2  45.45 
 
 
347 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000777998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  45.82 
 
 
376 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.6 
 
 
361 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  49.31 
 
 
323 aa  299  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  47.08 
 
 
342 aa  299  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0868  peptide chain release factor 2  46.08 
 
 
374 aa  298  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>