115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5313 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5313  response regulator receiver protein  100 
 
 		 117 aa  230  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.171465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3685  response regulator receiver protein  61.22 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4627  response regulator receiver protein  41.28 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.910799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2302  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 571 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 953 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2932  two-component response regulator  41.77 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  41.77 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  34.82 
 
 		 264 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2725  two-component response regulator  44.3 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.127392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4399  two-component response regulator  44.3 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.042433  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2822  two-component response regulator  36.71 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.230061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  35.45 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1274  two-component response regulator  40.51 
 
 		 269 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0337  two-component response regulator  44.3 
 
 		 265 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.101907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  35.78 
 
 		 264 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1388  two-component response regulator  37.97 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.740256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3566  two-component response regulator  35.44 
 
 		 275 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  38.6 
 
 		 241 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4028  two-component response regulator  36.71 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1368  two-component response regulator  36.71 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7001  two-component response regulator  36.71 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  37.97 
 
 		 264 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.04 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 337 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  30.91 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1246  two-component response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.660623  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.91 
 
 		 844 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  40.24 
 
 		 474 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_004310  BR1657  two-component response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0488  two-component response regulator  39.24 
 
 		 265 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.04 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2722  two-component response regulator  36.71 
 
 		 273 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1604  two-component response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2771  two-component response regulator  36.71 
 
 		 268 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4704  two-component response regulator  36.71 
 
 		 268 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.868333  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.02 
 
 		 461 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  41.03 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3837  two-component response regulator  37.97 
 
 		 271 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.539705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0089  two-component response regulator  43.04 
 
 		 266 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7150  response regulator  34.86 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5008  two-component response regulator  42.5 
 
 		 267 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16011  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 376 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.07 
 
 		 432 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0250  two-component response regulator  36.71 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 450 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.9 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3278  two-component response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442682  hitchhiker  0.00956717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0694  response regulator  36.9 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 352 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3109  two-component response regulator  39.24 
 
 		 265 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  37.35 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3521  two-component response regulator  43.59 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3026  two-component response regulator  39.24 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.246349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  36.21 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 450 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 258 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 359 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  36.14 
 
 		 429 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  38.55 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3029  two-component response regulator  41.25 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.37 
 
 		 455 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6000  two-component response regulator  37.97 
 
 		 264 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 589 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2905  two-component response regulator  41.77 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 766 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3131  two-component response regulator  41.25 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.734649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 384 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  34.15 
 
 		 429 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 642 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 2107 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.52 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 2072 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0050  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.94 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  37.18 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  33.73 
 
 		 231 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1800  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.13 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.458412  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6002  response regulator  32.73 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.282143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0286  two-component response regulator  36.71 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173395 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1748  response regulator receiver and unknown domain protein  30.36 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.013924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  26.92 
 
 		 858 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  28.4 
 
 		 667 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 472 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 234 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 721 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 798 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  29.91 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  36.14 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 229 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2024  two-component response regulator  31.25 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.363014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4556  response regulator  35.8 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.15 
 
 		 455 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>