More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3416 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3416  signal peptidase I  100 
 
 		 255 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1736  signal peptidase I  49.47 
 
 		 282 aa  265  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.486062  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0949  signal peptidase I  50 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.477525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2628  signal peptidase I  48.54 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257751  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  48.12 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0660  signal peptidase I  47.88 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0653  signal peptidase I  47.88 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.245969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  45.83 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  45.83 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  46.26 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  46.09 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  44.27 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0992  signal peptidase I  45.45 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3880  signal peptidase I  45.24 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2252  peptidase S26A, signal peptidase I  44.27 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1919  peptidase S26A, signal peptidase I  43.87 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.455712 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0472  signal peptidase I  46.44 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.786114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2650  peptidase S26A, signal peptidase I  42.29 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0288033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2611  peptidase S26A, signal peptidase I  41.9 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2442  signal peptidase I  44.05 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2639  peptidase S26A, signal peptidase I  41.67 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2971  signal peptidase I  42.86 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  45.83 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0420  signal peptidase I  43.23 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0784  signal peptidase I  42.8 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.866846  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  42.11 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  41.18 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  42.11 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0252  peptidase S26A, signal peptidase I  43.35 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0374  signal peptidase I  40.67 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386992  normal  0.71922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7364  signal peptidase I  42.51 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00862712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0824  signal peptidase I  45.7 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.513992 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0362  signal peptidase I  40.17 
 
 		 236 aa  176  5e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.814015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0521  signal peptidase I  41.83 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6615  signal peptidase I  42.51 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4784  peptidase S26A, signal peptidase I  46.43 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1808  signal peptidase I  39.34 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3456  signal peptidase I  40.94 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1214  peptidase S26A, signal peptidase I  40.15 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0164929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1373  signal peptidase I  46.46 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.2074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4593  peptidase S26A, signal peptidase I  42.42 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2548  signal peptidase I  41.56 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0109556  normal  0.0405756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2273  signal peptidase I  41.56 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0892  signal peptidase I  44.69 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2231  signal peptidase I  41.15 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177847  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0249  signal peptidase I  40.87 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0893  signal peptidase I  38.68 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.215709  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0690  signal peptidase I  40 
 
 		 235 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.968809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  37.64 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2871  signal peptidase I  42.45 
 
 		 245 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3871  signal peptidase I  41.1 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2560  signal peptidase I  36.04 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0947961  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1410  peptidase S26A, signal peptidase I  38.55 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  41.38 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  42.86 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  38.43 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  38.84 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  35.83 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0909  signal peptidase I  42.13 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  34.7 
 
 		 240 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  39.39 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2598  prokaryotic type I signal peptidase  40 
 
 		 317 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  34.62 
 
 		 305 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  40 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  38.33 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  37.39 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  34.01 
 
 		 381 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  37.68 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  37.68 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  38.57 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2504  signal peptidase I  35.04 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000062636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0838  signal peptidase I  38.75 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32385  normal  0.02966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4123  signal peptidase I  35.25 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  38.43 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  36.2 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  40.47 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  38.32 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  37.39 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  35.48 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  38.46 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  33.97 
 
 		 305 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  36.82 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  36.09 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  36.09 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  37.05 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  36.09 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  36.09 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  40.7 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  36.24 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  39.42 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  37.9 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  37.5 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  39.71 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  35.65 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  40.65 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  39.71 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  37.04 
 
 		 297 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  36.92 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  34.07 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>