More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3112 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  100 
 
 		 633 aa  1235    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.38 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  32.81 
 
 		 323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35.45 
 
 		 447 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  34.51 
 
 		 530 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  34.25 
 
 		 328 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  51.61 
 
 		 465 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  34.15 
 
 		 534 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  23.38 
 
 		 602 aa  131  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  48.7 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  49.57 
 
 		 478 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  48.7 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  50.43 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  30.8 
 
 		 427 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  47.83 
 
 		 471 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  30.8 
 
 		 427 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  29.8 
 
 		 298 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  47.83 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  46.96 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  31.58 
 
 		 310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.61 
 
 		 293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  33.92 
 
 		 284 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  31.46 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  47.83 
 
 		 501 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  45.38 
 
 		 538 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  47.83 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  48.7 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.43 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  47.41 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  47.06 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  48.7 
 
 		 494 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  47.83 
 
 		 446 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  47.83 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  47.83 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  30.9 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  31.6 
 
 		 262 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  31.6 
 
 		 262 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  29.59 
 
 		 401 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  30.72 
 
 		 296 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  31.34 
 
 		 288 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  32.76 
 
 		 285 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  30.3 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  30.3 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  30.3 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  30.3 
 
 		 377 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  29.78 
 
 		 754 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  31.91 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  46.88 
 
 		 291 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  46.88 
 
 		 294 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  29.97 
 
 		 377 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  32.23 
 
 		 265 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  31.08 
 
 		 360 aa  104  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  46.09 
 
 		 292 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  40.62 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  37.93 
 
 		 230 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  41.5 
 
 		 387 aa  103  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  31.18 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  29.21 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  29.21 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  27.27 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  40.31 
 
 		 309 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.97 
 
 		 751 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  40.58 
 
 		 270 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.3 
 
 		 1001 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  28.63 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  40.28 
 
 		 312 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.46 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  40.31 
 
 		 304 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  40 
 
 		 230 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.66 
 
 		 509 aa  99.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.69 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  38.06 
 
 		 249 aa  99.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  26.9 
 
 		 311 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 		 344 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  28.95 
 
 		 397 aa  99.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.06 
 
 		 289 aa  98.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  28.78 
 
 		 468 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.09 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.09 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.09 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.09 
 
 		 296 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.09 
 
 		 236 aa  98.2  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.09 
 
 		 296 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.09 
 
 		 233 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  28.42 
 
 		 345 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  29.07 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  29.07 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.43 
 
 		 304 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  29.07 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  29.07 
 
 		 363 aa  97.8  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  35.03 
 
 		 298 aa  97.8  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  39.84 
 
 		 251 aa  97.8  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  43.31 
 
 		 238 aa  97.8  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  29.07 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  29.07 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  26.74 
 
 		 430 aa  97.8  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  35.03 
 
 		 298 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  35.03 
 
 		 298 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  35.03 
 
 		 298 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>