268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2951 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  100 
 
 
1031 aa  2046    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  40.21 
 
 
1022 aa  597  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  39.9 
 
 
1022 aa  571  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  37.13 
 
 
1023 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0549  exonuclease SbcC, putative  32.48 
 
 
859 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  32.72 
 
 
1019 aa  366  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  31.55 
 
 
1008 aa  361  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  29.3 
 
 
1016 aa  356  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  28.07 
 
 
1008 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  28.07 
 
 
1008 aa  316  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1142  SMC domain protein  24.16 
 
 
857 aa  250  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  41.36 
 
 
859 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_490  DNA repair ATPase  40 
 
 
859 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  28.8 
 
 
1007 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  31.5 
 
 
1003 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  36.29 
 
 
1007 aa  197  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  23.6 
 
 
1018 aa  120  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  19.25 
 
 
993 aa  111  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  21.45 
 
 
1011 aa  111  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  18.86 
 
 
993 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  24.38 
 
 
1091 aa  102  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 
906 aa  95.1  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  29.41 
 
 
1029 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.97 
 
 
924 aa  93.6  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  36.24 
 
 
1029 aa  92.8  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.4 
 
 
961 aa  91.7  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  34.9 
 
 
1029 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.91 
 
 
891 aa  90.1  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  34.9 
 
 
1029 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  34.9 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  34.9 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  34.9 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  34.9 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  34.9 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  35.16 
 
 
1234 aa  88.2  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  34.23 
 
 
1029 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  34.23 
 
 
1029 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  19.59 
 
 
993 aa  87  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  28.03 
 
 
810 aa  86.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.99 
 
 
891 aa  85.9  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.57 
 
 
895 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  33.13 
 
 
995 aa  84  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  30.21 
 
 
890 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  31.62 
 
 
1164 aa  83.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  32.35 
 
 
824 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  31.51 
 
 
1030 aa  81.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.53 
 
 
994 aa  81.6  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  33.49 
 
 
902 aa  81.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  28.21 
 
 
1049 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  24.64 
 
 
693 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  22.82 
 
 
1108 aa  77.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  37.01 
 
 
1227 aa  77.4  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  29.15 
 
 
1018 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  31.25 
 
 
1230 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  34.03 
 
 
1020 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  37.4 
 
 
1048 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  37.4 
 
 
1048 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  34.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  34.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  29.1 
 
 
1307 aa  76.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  36.36 
 
 
1229 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  37.4 
 
 
1048 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  36.36 
 
 
1220 aa  77  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  37.4 
 
 
1047 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  34.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  36.36 
 
 
1229 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  34.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  34.75 
 
 
1018 aa  77  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  28.88 
 
 
1346 aa  76.3  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  36.07 
 
 
1083 aa  76.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  30.61 
 
 
1017 aa  76.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  28.35 
 
 
1018 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  28.57 
 
 
1303 aa  75.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  32.05 
 
 
881 aa  75.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  28 
 
 
1038 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  31.86 
 
 
824 aa  75.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  34.75 
 
 
1018 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  27.76 
 
 
1219 aa  75.1  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.74 
 
 
1018 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  33.61 
 
 
1018 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  30.25 
 
 
1137 aa  74.7  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2563  exonuclease SbcC  33.33 
 
 
1000 aa  74.7  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.679449  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  29.7 
 
 
953 aa  73.9  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  29.27 
 
 
1238 aa  73.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  29.8 
 
 
1144 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  33.9 
 
 
1018 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  31.18 
 
 
1226 aa  73.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  32.77 
 
 
1018 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  35.43 
 
 
1227 aa  73.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  36.13 
 
 
1042 aa  72.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 
1224 aa  72.4  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  35.88 
 
 
1226 aa  72  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  33.1 
 
 
1039 aa  72  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  30.25 
 
 
1247 aa  70.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  28.98 
 
 
1223 aa  71.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>