112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7489 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 100 aa  194  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  53.49 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  45.88 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  48.24 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3220  putative transcriptional regulator  44.58 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00911883  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  42.27 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0273  transcriptional regulator, HxlR family  39.56 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.394727  normal  0.0155741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  40.96 
 
 		 212 aa  57  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  36.9 
 
 		 118 aa  52  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  36.08 
 
 		 218 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  34.88 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2460  transcriptional regulator, HxlR family  39.77 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2428  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 119 aa  47.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3785  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139955  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  43.53 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  38.55 
 
 		 246 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  35.23 
 
 		 119 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3534  transcriptional regulator, HxlR family  37.21 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  30.68 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0843  transcriptional regulator, HxlR family  31.82 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  40.91 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  34.09 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0313  HxlR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.250935  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27270  predicted transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0592087  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2207  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0386773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  31.25 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 237 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2378  transcriptional regulator, HxlR family  30 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.415672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0163  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379253  hitchhiker  0.00857335 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2323  hypothetical protein  39.29 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0166968  normal  0.857189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4559  transcriptional regulator, HxlR family  32.56 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0042  transcriptional regulator, HxlR family  32.95 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0026  transcriptional regulator, HxlR family  34.48 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0720  cinnamoyl ester hydrolase  27.38 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  29.21 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  34.94 
 
 		 154 aa  42  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  33.7 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  29.79 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  34.48 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  33.96 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2195  transcriptional regulator, HxlR family  26.6 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2747  transcriptional regulator, HxlR family  30.59 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  29.17 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  38.37 
 
 		 239 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4029  transcriptional regulator, HxlR family  31.76 
 
 		 122 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  34.44 
 
 		 225 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  32.61 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0287  transcriptional regulator, HxlR family  36.47 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3335  transcriptional regulator, HxlR family  31.87 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7105  transcriptional regulator protein-like protein  40.28 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  32.22 
 
 		 107 aa  40.8  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 119 aa  40.8  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2124  HxlR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 136 aa  40.8  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0738  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2915  transcriptional regulator, HxlR family  32.98 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>