More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0720 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0720  cinnamoyl ester hydrolase  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0738  putative transcriptional regulator  98.17 
 
 		 110 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.254703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1850  HxlR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 114 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  34.31 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  37.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  37.63 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1319  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3142  helix-turn-helix, HxlR type  34.41 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933421  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1884  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.189342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  35.29 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  27.72 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  38 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  38 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  38 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  31.31 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  36 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  37.89 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  36.27 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1140  transcriptional regulator, HxlR family  33.66 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0964715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02523  hypothetical transcriptional regulator  35.35 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  28.87 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  29 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  32.38 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0207  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  27.45 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  35 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  34.69 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  29.9 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06336  hypothetical protein  34.38 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  33.66 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5876  transcriptional regulator, HxlR family  31.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal  0.496551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  36.45 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1097  transcriptional regulator, HxlR family  32.29 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  34.04 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1352  transcriptional regulator, HxlR family  36.63 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  30.39 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3484  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.816245  normal  0.77191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7246  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00534813  normal  0.675501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2483  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0347086  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  30.85 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  34.31 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>