More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7301 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  100 
 
 		 704 aa  1373    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  44.78 
 
 		 741 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  42.6 
 
 		 732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  31.76 
 
 		 766 aa  264  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.48 
 
 		 743 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.82 
 
 		 717 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  33.21 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  33.14 
 
 		 723 aa  241  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  32.53 
 
 		 743 aa  240  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.94 
 
 		 842 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  33.57 
 
 		 737 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 770 aa  239  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  30.97 
 
 		 733 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  31.84 
 
 		 1155 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  34.85 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  34.85 
 
 		 754 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  31.39 
 
 		 704 aa  235  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.71 
 
 		 735 aa  234  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  33.52 
 
 		 751 aa  231  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  30.63 
 
 		 737 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.37 
 
 		 832 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  35.76 
 
 		 745 aa  228  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.41 
 
 		 829 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.41 
 
 		 829 aa  227  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  33.88 
 
 		 736 aa  226  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.69 
 
 		 735 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  33.77 
 
 		 983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  31.74 
 
 		 742 aa  226  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  32.62 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  33.77 
 
 		 983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  32.62 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  34.93 
 
 		 761 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  35.12 
 
 		 758 aa  223  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  34.47 
 
 		 846 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 718 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.96 
 
 		 979 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  32.72 
 
 		 727 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.6 
 
 		 893 aa  220  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.04 
 
 		 723 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.62 
 
 		 781 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  33.54 
 
 		 978 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  33.76 
 
 		 738 aa  218  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  31.58 
 
 		 738 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  29.63 
 
 		 752 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  32.19 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  35.29 
 
 		 731 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  32.74 
 
 		 767 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  32.74 
 
 		 767 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.55 
 
 		 717 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.43 
 
 		 724 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  32.74 
 
 		 767 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  30.69 
 
 		 755 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.2 
 
 		 729 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  34.36 
 
 		 734 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  33.33 
 
 		 966 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  32.26 
 
 		 740 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  30.61 
 
 		 735 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  27.11 
 
 		 730 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.55 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.89 
 
 		 968 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.8 
 
 		 1013 aa  211  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  33.05 
 
 		 724 aa  210  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.52 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  33.21 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  29.9 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  30.85 
 
 		 796 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  30.52 
 
 		 726 aa  208  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.58 
 
 		 730 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  32.25 
 
 		 732 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  32.75 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  30.42 
 
 		 735 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  30.87 
 
 		 741 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  31.71 
 
 		 734 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  28.53 
 
 		 746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.22 
 
 		 729 aa  201  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  31.63 
 
 		 711 aa  201  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.14 
 
 		 757 aa  200  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  34.81 
 
 		 743 aa  200  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.58 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 736 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  28.87 
 
 		 779 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.4 
 
 		 738 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  29.67 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  31.54 
 
 		 749 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  29.75 
 
 		 732 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  30.73 
 
 		 805 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  29.75 
 
 		 783 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  32.42 
 
 		 731 aa  193  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.17 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  29.7 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7430  MMPL domain protein  31.57 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  30.45 
 
 		 793 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  30.91 
 
 		 734 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  31.62 
 
 		 787 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  27.53 
 
 		 760 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  30.04 
 
 		 737 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  32.3 
 
 		 750 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8716  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 745 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14053  decreased coverage  0.00441671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.02 
 
 		 740 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  33.59 
 
 		 738 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>