110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6504 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 580 aa  1135    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 		 329 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  67.71 
 
 		 691 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  67.35 
 
 		 592 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  29.95 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  30.83 
 
 		 484 aa  107  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  47.1 
 
 		 1147 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  61.17 
 
 		 1243 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.17 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  26.25 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  52.87 
 
 		 586 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.82 
 
 		 426 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 312 aa  97.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.48 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  53.68 
 
 		 1131 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 467 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  26.18 
 
 		 358 aa  94  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  28.74 
 
 		 356 aa  94  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 307 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  61.46 
 
 		 597 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  26.4 
 
 		 343 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 418 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  45.45 
 
 		 583 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 583 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  29.44 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.91 
 
 		 1115 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  25.96 
 
 		 384 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.91 
 
 		 1115 aa  87  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 793 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  52.04 
 
 		 601 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  43.61 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  58.56 
 
 		 884 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  48.67 
 
 		 1077 aa  82  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  24.53 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.51 
 
 		 1119 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.4 
 
 		 1115 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  25.58 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.1 
 
 		 1115 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  24.12 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  24.28 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.44 
 
 		 927 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 1124 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  47.79 
 
 		 802 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  26.58 
 
 		 451 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  25.46 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  25.45 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  33.73 
 
 		 475 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.45 
 
 		 727 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  29.63 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  25.95 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.9 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 430 aa  67  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  24.4 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  37.19 
 
 		 892 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  22.82 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  24.89 
 
 		 430 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  24 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  24 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  24 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  24 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  24 
 
 		 430 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  23.56 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 		 1101 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.39 
 
 		 1154 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 724 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  25.1 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  22.08 
 
 		 1271 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 		 1118 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  22.65 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  23.31 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4283  metallophosphoesterase  35.65 
 
 		 717 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  21.71 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  22.93 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  35.14 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1672  hypothetical protein  30.25 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.987329  normal  0.944723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  23.46 
 
 		 647 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  20.54 
 
 		 470 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.23 
 
 		 835 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.25 
 
 		 721 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 835 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2916  hypothetical protein  41.35 
 
 		 398 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  32.26 
 
 		 847 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  37.72 
 
 		 1199 aa  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  36.84 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.58 
 
 		 554 aa  48.5  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  44.29 
 
 		 1124 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0874  hypothetical protein  28.5 
 
 		 674 aa  48.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.903939  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  27.38 
 
 		 1481 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  31.63 
 
 		 868 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.23 
 
 		 835 aa  47  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.89 
 
 		 771 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.38 
 
 		 836 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  25.95 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>