153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6167 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  780    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 423 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  39.85 
 
 		 408 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  38.81 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  38.33 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  36.27 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  33.68 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  30.84 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  30.14 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0222  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.69 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  30.59 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4433  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4458  major facilitator superfamily transporter  37.87 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1057  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3174  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  31.14 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0572  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2853  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4324  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69740  putative MFS transporter  28.54 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.511622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01577  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01860)  27.65 
 
 		 539 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0938602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6025  MFS transporter  35.76 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.85 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1763  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.33 
 
 		 407 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3725  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01540  hexose transport-related protein, putative  28.72 
 
 		 557 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  27.46 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1103  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.97 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.278959  decreased coverage  0.00752766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  34.86 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5459  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243673  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  34.29 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04206  multidrug efflux system protein  26.67 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.652544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3658  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04169  hypothetical protein  26.67 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.596573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4939  multidrug resistance protein MdtM  28.28 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3364  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.91 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  37.93 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  35.64 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 463 aa  46.6  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02974  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 477 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  25.69 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.89 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.89 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.29 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  37.11 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.79 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.94 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2634  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.93 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4767  multidrug resistance protein MdtM  26.32 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 403 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1609  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  33.06 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4565  multidrug resistance protein MdtM  27.59 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 529 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4884  multidrug resistance protein MdtM  28.84 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>