More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5227 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0877  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1145  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4095  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3819  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3900  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4204  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4007  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2692  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4040  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3748  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 256 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4112  short chain dehydrogenase  39.23 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.374881  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07120  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH) precursor related protein  37.13 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3732  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1818  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 278 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.913032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1148  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.09 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1758  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.259984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2773  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.96 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2928  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.96 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.12909  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0291  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.75 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 268 aa  149  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0129049  hitchhiker  0.0000238607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0891264  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2037  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0153445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1982  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000445056  unclonable  0.000000000077368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.499574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2628  2, 4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)-related protein  36.8 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2397  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2049  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0464745  hitchhiker  0.000360099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2391  short chain dehydrogenase  35.85 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00010416  unclonable  0.0000108368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.8 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1203  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5205  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 294 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00959428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2071  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00111484  unclonable  0.00000000000219735 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2075  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000264648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2274  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000319086  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1929  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000156385  unclonable  0.0000000000437203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2118  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000143066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 285 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1741  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00532384  hitchhiker  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3281  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  34.1 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1031  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0687458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1336  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.0949084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  33.21 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 258 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  34.09 
 
 		 255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.278659  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.88 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>