64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1891 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 304 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  78.45 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  49.6 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  54 
 
 		 376 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  45.13 
 
 		 416 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  56.67 
 
 		 1216 aa  79.3  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  40.45 
 
 		 1086 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  37.33 
 
 		 969 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0409  peptidoglycan-binding LysM  57.38 
 
 		 1385 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.617719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  52.24 
 
 		 767 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  38.54 
 
 		 1736 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2587  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  51.43 
 
 		 992 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4039  transcriptional regulator, SARP family  39.77 
 
 		 1041 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.039203  normal  0.0409603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0678  transcriptional regulator, SARP family  44.44 
 
 		 1066 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1730  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  40.41 
 
 		 988 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0938978  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  42.55 
 
 		 1566 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  45.45 
 
 		 935 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  41.11 
 
 		 1276 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8210  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1090 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6300  hypothetical protein  56 
 
 		 1655 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  51.92 
 
 		 1091 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  38.46 
 
 		 1124 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 		 1079 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1002 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  40.2 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  46.67 
 
 		 743 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  38.46 
 
 		 1510 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  38.46 
 
 		 1510 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  39.24 
 
 		 994 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3125  integral membrane protein  50 
 
 		 628 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.435846  hitchhiker  0.000875177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  34.9 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  37.31 
 
 		 1147 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.06 
 
 		 954 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  32 
 
 		 1082 aa  52.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  38.1 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  50 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3327  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 1123 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1315  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  33.33 
 
 		 2066 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 521 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  33.33 
 
 		 2066 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1309 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.55 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  31.2 
 
 		 511 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  34.38 
 
 		 97 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  45.31 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  64.52 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.01 
 
 		 590 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  34.44 
 
 		 546 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  37.35 
 
 		 651 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  64.52 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1787  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 660 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.11 
 
 		 190 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  37.84 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  39.02 
 
 		 388 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.32 
 
 		 155 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  36.9 
 
 		 390 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>