19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0731 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 289 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  77.88 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  38.42 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  53 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  42.98 
 
 		 416 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  37.98 
 
 		 1736 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 		 1216 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  44.68 
 
 		 1566 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  39.6 
 
 		 1276 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  47.76 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  37.78 
 
 		 1510 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  37.78 
 
 		 1510 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  45.31 
 
 		 376 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  32.63 
 
 		 2066 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  32.63 
 
 		 2066 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  47.17 
 
 		 743 aa  49.7  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  35.88 
 
 		 996 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>