22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30070 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  100 
 
 		 278 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  68.97 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  53.33 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  46.92 
 
 		 416 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  44.26 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 		 767 aa  92.4  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 1216 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  36.21 
 
 		 1736 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  40.48 
 
 		 1566 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  47.06 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  37.08 
 
 		 1510 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  37.08 
 
 		 1510 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  35.34 
 
 		 2066 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  35.34 
 
 		 2066 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  35.78 
 
 		 743 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  42.03 
 
 		 1276 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  34.67 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>