25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4936 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  67.24 
 
 		 376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  52.63 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  51.89 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  53 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  42.31 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 		 1216 aa  79  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  39.13 
 
 		 1736 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 767 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  50.75 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  35.65 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  37.93 
 
 		 1566 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  46.27 
 
 		 1510 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  46.27 
 
 		 1510 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  35.53 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  39.58 
 
 		 1276 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  38.71 
 
 		 2066 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  38.71 
 
 		 2066 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  42.25 
 
 		 743 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0561  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1911  soluble lytic murein transglycosylase  32.54 
 
 		 296 aa  45.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0241391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2468  lytic transglycosylase catalytic  30.46 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 		 460 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  29.31 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  32.54 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>