26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1417 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  29.05 
 
 		 312 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  28.64 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  27.92 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1442  hypothetical protein  26.37 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0620  Phage related protein  27.07 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0683  Phage related protein  27.07 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  51.79 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  51.79 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  41.18 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  31.3 
 
 		 1095 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.18 
 
 		 627 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1315  peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.25781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.76 
 
 		 954 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  44.83 
 
 		 1051 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  37.68 
 
 		 927 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 1086 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 		 1079 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  37.68 
 
 		 924 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 		 318 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  36.54 
 
 		 638 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  42 
 
 		 677 aa  41.6  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  48.48 
 
 		 349 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>