57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0848 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  100 
 
 		 743 aa  1536    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  45.87 
 
 		 1216 aa  92.4  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  35.11 
 
 		 2066 aa  77.4  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  35.11 
 
 		 2066 aa  77.4  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  35.78 
 
 		 278 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  31.91 
 
 		 453 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 304 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.06 
 
 		 468 aa  54.3  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 		 278 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  34.26 
 
 		 269 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  34.38 
 
 		 417 aa  51.6  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.14 
 
 		 455 aa  50.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  42.25 
 
 		 376 aa  50.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  30.82 
 
 		 456 aa  50.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.37 
 
 		 423 aa  50.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  32.38 
 
 		 414 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1072  hypothetical protein  24.89 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  30.14 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1093  hypothetical protein  24.89 
 
 		 527 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  47.17 
 
 		 289 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  34.76 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1105  NLP/P60 protein  29.17 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  31.43 
 
 		 454 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  35.05 
 
 		 402 aa  49.3  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  43.3 
 
 		 436 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  36.73 
 
 		 1510 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  30.14 
 
 		 457 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  41.03 
 
 		 416 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  36.73 
 
 		 1510 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  29.63 
 
 		 459 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  36.56 
 
 		 301 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  31.5 
 
 		 346 aa  47.8  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  31.67 
 
 		 303 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  32.48 
 
 		 490 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  35.48 
 
 		 321 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  32.67 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  32.67 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.38 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  29.84 
 
 		 325 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.98 
 
 		 314 aa  45.8  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  38.16 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  27.52 
 
 		 449 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.79 
 
 		 524 aa  45.4  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  34.58 
 
 		 751 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  31.93 
 
 		 735 aa  45.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  25.45 
 
 		 475 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  29.29 
 
 		 347 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  34.95 
 
 		 334 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  27.03 
 
 		 465 aa  44.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  45.76 
 
 		 302 aa  44.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  31.5 
 
 		 375 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.89 
 
 		 462 aa  44.3  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  35.92 
 
 		 727 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  35.92 
 
 		 727 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  31.09 
 
 		 482 aa  44.3  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  36.27 
 
 		 538 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.15 
 
 		 430 aa  44.3  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>