More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4161 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  29 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  40.8 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.28 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  38.28 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  26.49 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  40.78 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.89 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  35.71 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  26.12 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  35.54 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40.98 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  28.19 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.77 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  41.58 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  42.57 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  35.77 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.52 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  35.29 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.38 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  35.34 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  32.41 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  35.11 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  35.14 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  35.14 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  33.33 
 
 
482 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  38.66 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.03 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  33.33 
 
 
453 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  40.57 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  36.44 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  32.52 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  37.01 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.89 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  28.23 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  26.51 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  27.96 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  34.72 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  33.33 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  37.4 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  41 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  32.58 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  32.33 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.71 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  32.64 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  35.59 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  33.15 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  39.29 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  32.64 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  40.21 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  36.21 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.45 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  29.2 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.88 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.94 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.45 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  40.21 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  38.89 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  35.59 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.33 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  34.69 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  33.61 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  31.03 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40.94 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  36.89 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  36.36 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  40.21 
 
 
470 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.33 
 
 
300 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  40 
 
 
438 aa  72  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.92 
 
 
411 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  38.98 
 
 
630 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  30.43 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  41.05 
 
 
424 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  38.95 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  31.95 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.59 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  42.05 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  40 
 
 
491 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  29 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  42.05 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  33.54 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  30.89 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.25 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.51 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  24.18 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  29.02 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 
498 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  39 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.92 
 
 
387 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.07 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  28.85 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  34.11 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  36.67 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  34.55 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  39 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  39.2 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  33.6 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  41.05 
 
 
431 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>