More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0282 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  100 
 
 
263 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  32.36 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  30.04 
 
 
278 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  27.7 
 
 
327 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.66 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  24.06 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  35.96 
 
 
238 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  35.88 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  33.33 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  33.33 
 
 
457 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.91 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  39.42 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.74 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  32.57 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  30.3 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  33.8 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  29.48 
 
 
669 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.96 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.56 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  35.34 
 
 
453 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.78 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  33.33 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  25.42 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40.19 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  32.28 
 
 
681 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.46 
 
 
387 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  33.33 
 
 
392 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  27.91 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.33 
 
 
741 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.18 
 
 
464 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  32.67 
 
 
676 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  31.06 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.52 
 
 
465 aa  65.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  36.7 
 
 
695 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.14 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.77 
 
 
473 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  32.84 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  30.53 
 
 
524 aa  65.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.77 
 
 
472 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  30.71 
 
 
414 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.77 
 
 
475 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.93 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  30.81 
 
 
445 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.77 
 
 
473 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  29.65 
 
 
430 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  31.34 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.03 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  31.65 
 
 
699 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.58 
 
 
454 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  29.71 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  35.24 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  35.45 
 
 
455 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.54 
 
 
455 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  35.45 
 
 
347 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  39.6 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1627  M24/M37 family peptidase  38.39 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.33 
 
 
503 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  35.59 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  31.72 
 
 
385 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  30.99 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  30.28 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  37.61 
 
 
665 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  37.38 
 
 
446 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  32.68 
 
 
615 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.92 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  30.94 
 
 
697 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  32.31 
 
 
464 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  30.94 
 
 
697 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  33.64 
 
 
440 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.15 
 
 
468 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  35.19 
 
 
423 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  28.49 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  34.17 
 
 
325 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  33.65 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  31.71 
 
 
523 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.03 
 
 
470 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2157  peptidase, putative  24.81 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  29.86 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  30.89 
 
 
391 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  30.88 
 
 
687 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  36.36 
 
 
439 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  34.65 
 
 
324 aa  62.4  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.67 
 
 
569 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  35.59 
 
 
198 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  30.86 
 
 
465 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  31.71 
 
 
441 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  29.03 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.09 
 
 
411 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.92 
 
 
475 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35.61 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.15 
 
 
447 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.47 
 
 
503 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  35.65 
 
 
431 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  35.45 
 
 
459 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  35.45 
 
 
456 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.83 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  31.34 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  30.28 
 
 
415 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  35 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>