More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2157 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2157  peptidase, putative  100 
 
 		 256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2447  putative peptidase  98.05 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  31.03 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  29.18 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  33.04 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  38.52 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  34.31 
 
 		 291 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  33.81 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  28.8 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32.75 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  32.96 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  32.96 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  40.74 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  33.55 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  39.81 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.81 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.51 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  39.81 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  39.81 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  32.12 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  29.41 
 
 		 412 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  39.81 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  33.13 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.81 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  26.21 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  31.9 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  28 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  28 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.51 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.51 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.19 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.5 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  28.68 
 
 		 425 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  28.68 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.01 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  34.58 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  40 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.18 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.28 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  36.76 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  36.76 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  38.46 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  36.76 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.04 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.36 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  35.21 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.74 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  36.76 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  33.12 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  40.74 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  28.9 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  37.61 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  31.97 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  37.38 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  28.68 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  35.66 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.51 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.56 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  37.38 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.24 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  27.94 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  32.71 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  27.52 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  34.86 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  32.71 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.27 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  28.49 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  33.57 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.28 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  32.03 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  33.82 
 
 		 474 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  38.1 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  29.71 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  38.1 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.21 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.35 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  28.12 
 
 		 452 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  39.05 
 
 		 294 aa  62  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  28.35 
 
 		 375 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  31.51 
 
 		 300 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  34.31 
 
 		 455 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  25.11 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  31.53 
 
 		 332 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  34.31 
 
 		 451 aa  62  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  30 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.56 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  30.56 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  31.25 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  37.14 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  32.92 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  29.71 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  36.03 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  38.1 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.56 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.83 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  31.58 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>