More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2447 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2447  putative peptidase  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2157  peptidase, putative  98.05 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  32.59 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  29.18 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.53 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  32.53 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  34.31 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  28.8 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  37.78 
 
 
509 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32.75 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  31.89 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  31.89 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  32.54 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.53 
 
 
453 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  29.41 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  32.12 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  32.26 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  27.75 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  33.63 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  35.48 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.51 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  28 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.51 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  28 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  28.9 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  28.87 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  25.97 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.51 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  28.68 
 
 
425 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  32.74 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.01 
 
 
293 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  35.78 
 
 
455 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  32.74 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  28.68 
 
 
400 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  34.27 
 
 
311 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  34.58 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  36.76 
 
 
298 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  39.81 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  32.43 
 
 
438 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.36 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  40 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.28 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.2 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.82 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  38.89 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  35.21 
 
 
484 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.53 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  35.29 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  28.65 
 
 
452 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  35.66 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  38.89 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  38.46 
 
 
471 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.89 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  36.76 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  36.76 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  29.38 
 
 
394 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.04 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  36.76 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  30.32 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.53 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  28.68 
 
 
420 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  38.89 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  34.88 
 
 
417 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  35.78 
 
 
455 aa  63.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  33.99 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.51 
 
 
494 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  32.05 
 
 
500 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  40.74 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.56 
 
 
478 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.21 
 
 
324 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  29.71 
 
 
423 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  27.94 
 
 
425 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  27.52 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  32.03 
 
 
297 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  33.82 
 
 
474 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  38.1 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.35 
 
 
295 aa  62.4  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.09 
 
 
375 aa  62.4  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  38.1 
 
 
303 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  31.97 
 
 
415 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  30 
 
 
271 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  39.05 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  32.58 
 
 
299 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  29.89 
 
 
824 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  29.72 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.83 
 
 
313 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  34.31 
 
 
451 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  33.94 
 
 
454 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  30.56 
 
 
445 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  37.14 
 
 
299 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  34.31 
 
 
455 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  29.93 
 
 
378 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.56 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.27 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.56 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  38.1 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  29.71 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  38.1 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>