More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3146 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  25.82 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  34.97 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  36.92 
 
 		 287 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.19 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  38.32 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.07 
 
 		 321 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  31.4 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  29.86 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  27.95 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  31.75 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  30.65 
 
 		 404 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.8 
 
 		 423 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.17 
 
 		 430 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.54 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.29 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  30.3 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  29.14 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.79 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  27.42 
 
 		 524 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  39 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5547  stage II sporulation protein  28.1 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00247023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5403  stage II sporulation protein  27.69 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000422093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  29.49 
 
 		 398 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  30.16 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  35.51 
 
 		 582 aa  65.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  30.4 
 
 		 538 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  32.8 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  28.48 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  29.03 
 
 		 527 aa  65.5  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  28.57 
 
 		 392 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  31.34 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  35.92 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  26.19 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  28.93 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  39.22 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  38 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5373  stage II sporulation protein  27.69 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0925388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  33.09 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  33.67 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  29.22 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  29.29 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  28.95 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  31.06 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  33.98 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  27.74 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  28.85 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.39 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  29.92 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5407  stage II sporulation protein  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.388576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5131  stage II sporulation protein  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4964  stage II sporulation protein Q  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000820268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4982  stage II sporulation protein Q  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5524  stage II sporulation protein  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  31.07 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  29.07 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5458  stage II sporulation protein  32.67 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000429439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  30.3 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3801  peptidase M23B  33.55 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.769229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  28.57 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5080  peptidase M23B  32 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127894  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  34.45 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  32.04 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  26.54 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  32.31 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  33.08 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.5 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  29.07 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  33.06 
 
 		 501 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  36.89 
 
 		 459 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  29.31 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  30.65 
 
 		 372 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  31.2 
 
 		 379 aa  62  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  36.45 
 
 		 482 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.2 
 
 		 446 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  33.86 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  29.37 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  35.71 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  26.67 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  30.5 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  33.85 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  25.98 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  29.09 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  29.09 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  33.06 
 
 		 537 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.76 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  28.23 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  31.5 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  33.64 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  28.57 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  33.88 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  31.01 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  29.84 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  32.31 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  29.41 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  32 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.57 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  29.69 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  30 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>