More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1438 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  100 
 
 
457 aa  908    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  61.63 
 
 
447 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  48.78 
 
 
446 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  47.88 
 
 
448 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  42.95 
 
 
467 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  40.92 
 
 
453 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  42.06 
 
 
456 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  41.12 
 
 
453 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  41.12 
 
 
453 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  41.12 
 
 
453 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  40.84 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  40.84 
 
 
448 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  38.26 
 
 
445 aa  298  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  41.07 
 
 
445 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  42.06 
 
 
449 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  40.55 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  40.68 
 
 
460 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  40.67 
 
 
455 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  40.18 
 
 
452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  37.81 
 
 
484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.57 
 
 
469 aa  282  8.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  41.02 
 
 
449 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  38.67 
 
 
447 aa  278  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  39.78 
 
 
472 aa  275  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  40.09 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  36.14 
 
 
476 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  40.56 
 
 
464 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  40.13 
 
 
469 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  40.94 
 
 
460 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  36.4 
 
 
465 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  36.4 
 
 
465 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  38.41 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.96 
 
 
465 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  44.37 
 
 
455 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  35.09 
 
 
455 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  35.71 
 
 
467 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  34.44 
 
 
455 aa  245  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.39 
 
 
456 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  30.51 
 
 
460 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.18 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.62 
 
 
453 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  33.76 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.04 
 
 
470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  34.15 
 
 
462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.04 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  31.61 
 
 
461 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  30.02 
 
 
457 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.98 
 
 
460 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  28.86 
 
 
453 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  32.75 
 
 
464 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  32.6 
 
 
460 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.48 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.53 
 
 
440 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30.24 
 
 
485 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  30.32 
 
 
458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.46 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  31.14 
 
 
461 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  32.09 
 
 
460 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  27.97 
 
 
463 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.76 
 
 
470 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  30.44 
 
 
456 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  28.91 
 
 
462 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  29.74 
 
 
465 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  29.02 
 
 
456 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  31.69 
 
 
458 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  31.66 
 
 
461 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  28.97 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  31.21 
 
 
461 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  30.71 
 
 
488 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  27.94 
 
 
471 aa  154  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  30.99 
 
 
461 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  28.94 
 
 
465 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  28.76 
 
 
462 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  29.49 
 
 
469 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  27.74 
 
 
462 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  29.77 
 
 
468 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  26.67 
 
 
451 aa  150  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  28.1 
 
 
468 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  31.44 
 
 
455 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  28.45 
 
 
452 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  28.71 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  31.17 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  28.44 
 
 
458 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  28.46 
 
 
467 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  26.84 
 
 
465 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  27.43 
 
 
460 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  28.06 
 
 
471 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  28.06 
 
 
471 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  26.74 
 
 
463 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  28.75 
 
 
468 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  27.43 
 
 
468 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.12 
 
 
469 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  27.15 
 
 
463 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.39 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  27.61 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  28.24 
 
 
468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.93 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  29.15 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.77 
 
 
459 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.02 
 
 
456 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>