More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3958 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  100 
 
 		 396 aa  816    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.77 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.7 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  27 
 
 		 320 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  31.65 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  25.94 
 
 		 335 aa  113  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.88 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  31.78 
 
 		 357 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.91 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  31.67 
 
 		 268 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.1 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  29.91 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.96 
 
 		 309 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  25.6 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  24.03 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  25.54 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  24.73 
 
 		 324 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  25.51 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  23.76 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  24.6 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  25.68 
 
 		 318 aa  93.2  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  29.67 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  28.99 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  25.28 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  26.03 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.63 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.74 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  24 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  31.28 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.89 
 
 		 326 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  25.14 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  22.28 
 
 		 328 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  30.58 
 
 		 342 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  24.29 
 
 		 330 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  27.31 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  25.07 
 
 		 373 aa  90.1  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.61 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3504  anti-FecI sigma factor, FecR  28.5 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  23.99 
 
 		 345 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  25.55 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  22.38 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  28.64 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  33.33 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.85 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  26.33 
 
 		 320 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  25.28 
 
 		 337 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  28.28 
 
 		 342 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1450  anti-FecI sigma factor, FecR  32.71 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  23.3 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  24.11 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.75 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  25.23 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  29.58 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.32 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0701  anti-FecI sigma factor, FecR  23.06 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00519502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  22.86 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  27.98 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  23.85 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  24.27 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  28.51 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  27.98 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1076  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  29.1 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1833  FecR protein  28.77 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1107  putative FecR  33.17 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  29.73 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3834  anti-FecI sigma factor, FecR  23.62 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  27.52 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4751  anti-FecI sigma factor, FecR  27.11 
 
 		 344 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152327  normal  0.56762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  24.29 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  24.23 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  26.15 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  24.24 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.19 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  23.94 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1170  anti-FecI sigma factor, FecR  28.27 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  21.21 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  20.78 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  30.72 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  29.28 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.37 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  22.04 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  23.31 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  28.37 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  24.59 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.37 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  28.37 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  24.93 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  28.37 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.37 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>