164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1537 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  704    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  46.09 
 
 		 339 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  47.67 
 
 		 341 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  45.16 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  44.15 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  45.21 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  46.27 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  42.99 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  45.83 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  31.55 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  30.16 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 336 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  29.73 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  28.38 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.38 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.51 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.78 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.19 
 
 		 337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  30.57 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.62 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  30.25 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  27.54 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  25.22 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  25.67 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  25.61 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  30.73 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.37 
 
 		 330 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.98 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.67 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  23.83 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.65 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  24.21 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  22.27 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  24.07 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  25.11 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.18 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.9 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.4 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  23.14 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.23 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  26.37 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  25.73 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.49 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.49 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  22.5 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  22.02 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  24.11 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  23.41 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  21.96 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  27.63 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  21.18 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  23.53 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  26.4 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.01 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  22.34 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.81 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  24.41 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  23.53 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  19.12 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.38 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>