More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1092 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  100 
 
 		 584 aa  1195    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 737 aa  170  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 365 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 444 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  34.32 
 
 		 651 aa  137  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3454  histidine kinase  33.6 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2392  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 650 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0675  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  32.75 
 
 		 646 aa  123  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.779748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1956  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  29.48 
 
 		 359 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 655 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2081  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 396 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 819 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 721 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 1144 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 1383 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 952 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 761 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 770 aa  111  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.27 
 
 		 565 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 628 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2057  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.566261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3001  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 499 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 695 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 761 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  30.77 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 781 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0544  sensory box histidine kinase  30.47 
 
 		 717 aa  103  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  28.24 
 
 		 492 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 793 aa  103  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 1267 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 941 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 524 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  25.18 
 
 		 835 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  26.89 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 		 738 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  31.67 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3163  sensory box histidine kinase  32.3 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.16722  normal  0.0140597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 717 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3948  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 717 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  25.45 
 
 		 356 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 719 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 862 aa  101  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1637  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 656 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0556277  normal  0.025492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 662 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2263  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 632 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 929 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3822  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 717 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.834811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 592 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0543  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 717 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 575 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  27.07 
 
 		 600 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 642 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  28.44 
 
 		 392 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3952  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.173157  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 744 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 717 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3766  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 717 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0083  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 874 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 930 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5174  histidine kinase  26.87 
 
 		 273 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3487  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 717 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.61 
 
 		 1078 aa  99.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1953  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 632 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  28.96 
 
 		 382 aa  98.2  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  27.93 
 
 		 393 aa  98.2  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.04 
 
 		 397 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 678 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0211  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0352661  normal  0.776224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  33.19 
 
 		 554 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 554 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 881 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  28.89 
 
 		 354 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 763 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  26.04 
 
 		 379 aa  97.8  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  28.74 
 
 		 610 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 610 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 610 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  28.69 
 
 		 416 aa  97.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 763 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  32.27 
 
 		 337 aa  97.4  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 785 aa  97.4  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 604 aa  97.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  25.22 
 
 		 610 aa  97.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  25.54 
 
 		 496 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>