More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0461 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  100 
 
 		 325 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  54.95 
 
 		 323 aa  355  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  53.7 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  48.77 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  46.98 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  41.8 
 
 		 321 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  44.85 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  45.67 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  36.96 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  36.19 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  36.67 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  41.74 
 
 		 330 aa  188  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  40.55 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  43.29 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  39.91 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.56 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.5 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.4 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  34.84 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  37.12 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  36.11 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  36.4 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  30.27 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  35.71 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.75 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.25 
 
 		 320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.33 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  33.73 
 
 		 349 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  32.76 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  36.76 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  30.71 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.77 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  36.08 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30.94 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.3 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  34.57 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  29.5 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.62 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  29.58 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  29.58 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.48 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  34.87 
 
 		 299 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  37 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  33.19 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  33.08 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  29.24 
 
 		 330 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  34.5 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  28.47 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  28.11 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  34.07 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  32.27 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  31.43 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  29.6 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  33.77 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  31.06 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.75 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  31.56 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  30.08 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  29.72 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  35.35 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  35.68 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  34.01 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  29.66 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  36.12 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.87 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  34.17 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  30.24 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.62 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  34.74 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  33.86 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  33.19 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.81 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  35.63 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  30 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.42 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  28.15 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  35.59 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  36.28 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>