219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1027 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  100 
 
 		 306 aa  598  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  59.41 
 
 		 303 aa  338  7e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  40.96 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  35.67 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  35.57 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  35.23 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  33.45 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  34.01 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  31.64 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  33.88 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  34.54 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  33.46 
 
 		 304 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.29 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.21 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.21 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  32.62 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  34.56 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  33 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  32.77 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  32.23 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  31.36 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  31.38 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  32.66 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  32.18 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.67 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  27.55 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  28.42 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  25.83 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 316 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  28.36 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  26.42 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.74 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  29.23 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.35 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  26.12 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  26.77 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  24 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  26.12 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  22.77 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  23.87 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.85 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.18 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  21.8 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>