More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0766 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  85.35 
 
 		 430 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  100 
 
 		 430 aa  862    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  60.42 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  53.61 
 
 		 426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  52.56 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  52.09 
 
 		 429 aa  421  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  40.47 
 
 		 429 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  40.23 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  41.72 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  39.34 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 		 430 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.88 
 
 		 418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  36.53 
 
 		 425 aa  266  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  32.49 
 
 		 434 aa  239  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  39.2 
 
 		 314 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  24.88 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 379 aa  127  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.48 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.92 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.45 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.45 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  25.35 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  24.52 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  25.7 
 
 		 373 aa  121  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.11 
 
 		 407 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 371 aa  106  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  26.08 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 		 372 aa  103  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  25.52 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.46 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 		 386 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.71 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.56 
 
 		 386 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  25.81 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.61 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  24.14 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  24.15 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  22.99 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  29.41 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.61 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  33.59 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.99 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.9 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.58 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.35 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.66 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  24.43 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  21.67 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.39 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.05 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  32.09 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.85 
 
 		 855 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.72 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.7 
 
 		 400 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.53 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  21.65 
 
 		 863 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 658 aa  66.2  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  21.98 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  26.83 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  23.15 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.68 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  28.57 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.26 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.26 
 
 		 653 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.2 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.02 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  36.17 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.63 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  32.26 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  31.67 
 
 		 668 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.47 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  24.91 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.23 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3213  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.422328  normal  0.138688 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  33.09 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.78 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  28.36 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.97 
 
 		 653 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0943  ABC transporter component-like protein  30 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000599069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.28 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>