More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1389 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  100 
 
 		 359 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  57.57 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  53.94 
 
 		 344 aa  361  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  35.91 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.99 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.27 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.23 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  31.4 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.52 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.25 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.68 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.11 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.81 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.11 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.48 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  30.65 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.54 
 
 		 400 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.45 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  31.45 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.45 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  29.56 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.85 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.84 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.33 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.84 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  28.7 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.52 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  28.07 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  28.93 
 
 		 359 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  34.46 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  28.27 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3387  Rieske (2Fe-2S) region  27.09 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.0218971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.48 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  27.94 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.01 
 
 		 221 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  28.76 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.23 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.66 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  29.7 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.48 
 
 		 217 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.27 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.7 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7105  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.811582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  26.22 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  34.78 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  25.5 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.92 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.68 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1686  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.23 
 
 		 357 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 		 349 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3410  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 		 357 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  24.55 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.35 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  39.5 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  35.22 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  32.61 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  30.24 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  24.6 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  23.81 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  35.26 
 
 		 492 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.6 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.53 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  24.38 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  30.1 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  23.49 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  24.76 
 
 		 373 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  26.53 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1368  vanillate monooxygenase  30.23 
 
 		 352 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.93 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  28.45 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  24.84 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3307  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.68 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  23.17 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1488  Rieske (2Fe-2S) protein  26.5 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  26.9 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2081  hypothetical protein  31.86 
 
 		 278 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  27.59 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5416  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.4 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  24.43 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.05 
 
 		 347 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.91 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.93 
 
 		 355 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.38 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  25.83 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.78 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  35.23 
 
 		 438 aa  85.9  9e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.36 
 
 		 388 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3148  hypothetical protein  31.8 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  31.31 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  32.12 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.78 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  24.49 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.7 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  30.49 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  33.14 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  31.48 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>