More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3452 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 326 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  48.49 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  48.16 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  45.43 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  43.51 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  46.05 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  45.48 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  42.67 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  43.58 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  43.73 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  46.39 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  46.39 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  39.53 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  34.58 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  34.27 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  35.56 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  34.82 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  34.5 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  38.36 
 
 		 328 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  39.89 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  40.38 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  38.91 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  36.51 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  38.42 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  36.02 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  41.09 
 
 		 265 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  35.86 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  31.8 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  28.52 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  26.58 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.77 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.7 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  25.83 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  29.24 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.33 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.33 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.8 
 
 		 335 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  27.8 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  30.32 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.34 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  30.07 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  28.48 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.46 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  29.34 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  31 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  26.44 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  24.73 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  25.91 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  26.44 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  27.07 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  26.47 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.33 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  26.78 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  28.34 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  26.28 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  24.68 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  26.71 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.8 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  28.15 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  29.37 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  27.75 
 
 		 427 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  27.6 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.14 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  25.76 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  25.94 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  27.81 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0737  hypothetical protein  34.58 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  25.44 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  29.55 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  26.04 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  28.08 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  27.05 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  26.2 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 467 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0427  hypothetical protein  24.92 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  23.81 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  28.14 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>