More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1148 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  100 
 
 		 410 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  81.37 
 
 		 365 aa  609  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  74.58 
 
 		 361 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  73.06 
 
 		 386 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  73.39 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  73.39 
 
 		 358 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  74.79 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  66.93 
 
 		 376 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  67.32 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  69.32 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  55.9 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  55.87 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  58.28 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  54.47 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  55.37 
 
 		 355 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  54.08 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 		 353 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  49.87 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  51.41 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  53.71 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  48.46 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  53.92 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 369 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  51.69 
 
 		 369 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  50.56 
 
 		 369 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  50.43 
 
 		 348 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  48.01 
 
 		 355 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  51.6 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  49.15 
 
 		 358 aa  325  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  51.05 
 
 		 355 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  47.78 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  52.71 
 
 		 360 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  52.14 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  46.35 
 
 		 375 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  48.75 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  60 
 
 		 257 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  61.84 
 
 		 257 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  59.76 
 
 		 257 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.35 
 
 		 259 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  59.35 
 
 		 257 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  59.35 
 
 		 257 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  59.35 
 
 		 257 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  58.54 
 
 		 257 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  41.9 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.46 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.76 
 
 		 360 aa  269  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.15 
 
 		 377 aa  269  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 256 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 256 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 256 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 256 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 256 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.76 
 
 		 256 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.35 
 
 		 256 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.31 
 
 		 342 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  48.32 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  48.32 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.96 
 
 		 346 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  61.27 
 
 		 228 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  39.78 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.75 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  42.36 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.16 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.9 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  43.04 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  43.58 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  41.85 
 
 		 342 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.23 
 
 		 349 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.92 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  40.92 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.44 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 		 343 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  40.63 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  48.26 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  38.11 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  44.38 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  39.03 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.74 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  49.58 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.58 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 350 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46.74 
 
 		 349 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 		 356 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  42.81 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.56 
 
 		 343 aa  230  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 1057 aa  229  5e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  40.9 
 
 		 344 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  44.65 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.44 
 
 		 356 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.1 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  43.47 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>