More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2817 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2817  inner-membrane translocator  100 
 
 		 430 aa  827    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678214  normal  0.0943993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1319  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  82.09 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1606  inner-membrane translocator  65.8 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  63.4 
 
 		 741 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1401  inner-membrane translocator  46.17 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296284  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1860  inner-membrane translocator  46.44 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1452  inner-membrane translocator  48.93 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0642822  hitchhiker  0.000453493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1752  amino acid ABC transporter permease  50.53 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.550202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1493  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.532886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1334  inner-membrane translocator  53.09 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1295  inner-membrane translocator  56.25 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  60.52 
 
 		 761 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.52 
 
 		 755 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  60.52 
 
 		 758 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  60.52 
 
 		 749 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  60.52 
 
 		 746 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.28 
 
 		 752 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4559  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  57.14 
 
 		 409 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  60.23 
 
 		 746 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1393  inner-membrane translocator  56.81 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0933  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.532515  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1415  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.446365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1900  inner-membrane translocator  56.18 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0224  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2932  inner-membrane translocator  48.73 
 
 		 440 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.303159  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1681  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2023  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.102668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2576  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262012  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3167  inner-membrane translocator  51.06 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581238  normal  0.308914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1795  inner-membrane translocator  44.53 
 
 		 422 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1839  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4169  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3310  inner-membrane translocator  42 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.021749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1772  putative amino acid transport system permease lipoprotein transmembrane  45.6 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2928  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0634587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2389  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0550478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1851  inner-membrane translocator  41.15 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1578  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.703431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1572  inner-membrane translocator  41.45 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4566  inner-membrane translocator  43.87 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1575  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0023  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.24 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0026  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0547  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  34.47 
 
 		 852 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.55 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0059  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0244383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.96 
 
 		 656 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3735  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  37.55 
 
 		 318 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6489  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.635062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 330 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4327  inner-membrane translocator  31.32 
 
 		 646 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0490651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4063  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 632 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141363  normal  0.461236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  31.43 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4462  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 633 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906456  normal  0.226245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0052  inner-membrane translocator  31.5 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0658  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.6 
 
 		 646 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.755349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8053  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4452  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3320  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 334 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  30.88 
 
 		 838 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  32.49 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  29.58 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  30.71 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 335 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  31.01 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1818  inner-membrane translocator  34.31 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5953  inner-membrane translocator  29.75 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  29.93 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0155  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 655 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4025  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3242  inner-membrane translocator  32.82 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.194129  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3293  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  31.14 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3759  hypothetical protein  29.54 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2932  inner-membrane translocator  30.53 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 642 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  31.27 
 
 		 632 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0173  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 635 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0422307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1583  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  32.17 
 
 		 625 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>