More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2179 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6667  major facilitator transporter  87.28 
 
 		 462 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2078  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  96.27 
 
 		 458 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454367  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2179  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6440  general substrate transporter  69.37 
 
 		 376 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0400024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3301  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 449 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1306  major facilitator transporter  56.66 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099547  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4728  major facilitator transporter  55.07 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0849  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 464 aa  179  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0146  General substrate transporter  31.82 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0462  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.042885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  28.8 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  28.8 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  28.8 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  28.76 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  28.57 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  28.76 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0730  General substrate transporter  30.63 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  28.54 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.54 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  28.54 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  28.54 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  28.54 
 
 		 500 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1860  proline/glycine betaine transporter  29.09 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  28.31 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  28.18 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2169  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  29.89 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0351  General substrate transporter  31.3 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0092051  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  30.61 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  31.11 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0658  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.848878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  27.5 
 
 		 500 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  30.91 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2703  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 535 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  30.02 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3365  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.15 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00021546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0131  general substrate transporter  30.2 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  28.92 
 
 		 500 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  31.15 
 
 		 531 aa  153  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  29.14 
 
 		 500 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0193  major facilitator family transporter  28.78 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  31.24 
 
 		 493 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0334  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  27.73 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  27.73 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3049  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2177  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  29.5 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1409  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0554976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5889  general substrate transporter  31.15 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 440 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  30.16 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0457  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1661  major facilitator family transporter  31.44 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  29.81 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0216  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1542  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.141245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10171  putative proline/betaine transporter, MFS family protein  28.84 
 
 		 420 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.643051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3288  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1451  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384828  normal  0.194977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4506  MFS family substrate transporter  30.91 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0158803 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0294  major facilitator superfamily permease  31.04 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.681741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2625  General substrate transporter  30.91 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.994681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.18 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  30.13 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1395  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.351043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3084  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0407  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.051048  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  29.88 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1559  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.956191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  30.47 
 
 		 491 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 442 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5304  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00630409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  31.16 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5249  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5997  general substrate transporter  31.19 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5978  general substrate transporter  30.25 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0713244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1251  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0968424  normal  0.933487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>