More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2806 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2806  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000293788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
218 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.72 
 
 
214 aa  234  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.25 
 
 
214 aa  234  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
214 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.3 
 
 
214 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
221 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 
216 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.76 
 
 
219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1605  ribulose-phosphate 3-epimerase (D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase)  48.84 
 
 
217 aa  218  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00660357  normal  0.751371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  51.89 
 
 
220 aa  217  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 
238 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.39 
 
 
224 aa  216  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
234 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  51.15 
 
 
234 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 
236 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.23 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.58 
 
 
211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
218 aa  214  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.84 
 
 
247 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  49.07 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  50.68 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.83 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
224 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
232 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.06 
 
 
227 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
217 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.77 
 
 
217 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.54 
 
 
221 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.85 
 
 
235 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.91 
 
 
220 aa  208  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
225 aa  207  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.64 
 
 
218 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 
230 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
219 aa  206  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
221 aa  205  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
221 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  50.5 
 
 
224 aa  202  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.62 
 
 
221 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.45 
 
 
220 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 
264 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.23 
 
 
244 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.6 
 
 
223 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
225 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
221 aa  201  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
225 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
219 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.17 
 
 
231 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.73 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.25 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  49.02 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.12 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.1 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.81 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  44.19 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.02 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.97 
 
 
218 aa  199  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  48.24 
 
 
220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.77 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3254  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.63 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0664105  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.37 
 
 
225 aa  198  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1306  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
214 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0153242  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1281  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.67 
 
 
214 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.27 
 
 
225 aa  197  9e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  46.92 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.14 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2540  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0480192 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.05 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  48.11 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 
224 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.4 
 
 
224 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.66 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.7 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 
222 aa  195  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.23 
 
 
218 aa  194  6e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
217 aa  194  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.18 
 
 
227 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
220 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  47.96 
 
 
219 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 
220 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.66 
 
 
243 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.6 
 
 
221 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1648  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.41 
 
 
214 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.65 
 
 
226 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.69 
 
 
227 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.33 
 
 
224 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.71 
 
 
221 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1319  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.12 
 
 
229 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0481  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
215 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2195  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.28 
 
 
216 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>