More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3218 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  90.86 
 
 		 382 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  91.41 
 
 		 382 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  100 
 
 		 373 aa  744    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  94.15 
 
 		 382 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  90.86 
 
 		 382 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  90.86 
 
 		 382 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  91.14 
 
 		 382 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  74.26 
 
 		 379 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  74.26 
 
 		 379 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  74.26 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  74.26 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  74.26 
 
 		 379 aa  551  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  71.05 
 
 		 379 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  68.33 
 
 		 385 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  66.11 
 
 		 377 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6973  porin  62.1 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02151  porin signal peptide protein  58.31 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  49.44 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  46.79 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  49.86 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  47.31 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  45.9 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0416  outer membrane protein (porin)  49.33 
 
 		 364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.441779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  45.78 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3196  outer membrane protein (porin)  48.09 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  45.63 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5128  outer membrane protein (porin)  49.73 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2109  outer membrane protein (porin)  47.79 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4595  outer membrane protein (porin)  49.18 
 
 		 364 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  48.88 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  44.57 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  45.6 
 
 		 372 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  45.7 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  44.48 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1076  outer membrane protein (porin)  45.81 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1076  outer membrane protein (porin)  45.81 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0592135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  42.18 
 
 		 382 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  39.57 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  36.77 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  37.99 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  36.64 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  34.22 
 
 		 357 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  40.62 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  36.91 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.51 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  35.54 
 
 		 353 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  35.18 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  35.43 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  35.81 
 
 		 386 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  36.41 
 
 		 402 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.99 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.99 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  35.81 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.37 
 
 		 353 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  33.59 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  34.29 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  34.29 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.96 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  33.68 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  33.94 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  32.9 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  34.63 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.21 
 
 		 379 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  34.04 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  34.94 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  33.66 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  35.46 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  31.97 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.38 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  34.2 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  34.76 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  34.2 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  34.34 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  32.98 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  34.34 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  33.94 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.27 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.67 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  33.25 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34.83 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.6 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.36 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.28 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.6 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.86 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  33.85 
 
 		 357 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.89 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  33.5 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.53 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  34.46 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.89 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  33.91 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  31.27 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.75 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  32.72 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  33.96 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  31.36 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>