More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2812 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  100 
 
 		 188 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  94.68 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  64.4 
 
 		 193 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  59.47 
 
 		 190 aa  244  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  55.85 
 
 		 188 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  50.53 
 
 		 190 aa  197  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  52.38 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  51.85 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  49.21 
 
 		 189 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  51.05 
 
 		 190 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  39.78 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  36.65 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  71.21 
 
 		 71 aa  94.7  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  33.51 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  32.11 
 
 		 228 aa  89  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.26 
 
 		 294 aa  85.1  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  34.55 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  36.43 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.9 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  28.27 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  28.85 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  32.05 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.69 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  32.69 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  27.27 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  33.15 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  26.04 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  29.41 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  32.96 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 		 308 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.04 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.04 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  30.11 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 313 aa  65.1  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.33 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 298 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  32.42 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  28.21 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  31.05 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  33.77 
 
 		 342 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  26.78 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4273  integrase family protein  28.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.42005  normal  0.068032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  30.49 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  33.75 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2107  integrase family protein  28.22 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.26894 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  28.02 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1335  Integrase  28.98 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.128026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.15 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  32.48 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0310  Integrase  28.98 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.004878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  30.77 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  29.12 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0030  Integrase  28.98 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.06 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1806  Integrase  28.98 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0548075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.4 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.22 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  31.06 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  30.19 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  30.6 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  30.99 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  29.67 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  26.42 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.95 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  29.01 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.19 
 
 		 322 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  30.39 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  27.98 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 303 aa  58.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.86 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.89 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  30.06 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 294 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 369 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  31.74 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.98 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 369 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  34.42 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  31.17 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.03 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.14 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>