251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3508 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 430 aa  853    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  43.65 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  37.97 
 
 		 424 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  36.01 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  37.17 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  37.38 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  35.73 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  35.55 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  35.13 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  36.39 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  28.26 
 
 		 494 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  28.37 
 
 		 732 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.36 
 
 		 432 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  32.22 
 
 		 380 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  30.8 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  32.6 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  35.02 
 
 		 381 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  29.38 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  31.11 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  31.37 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  32.37 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.79 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  31.11 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  34.7 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  33.33 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  34.15 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  32.96 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  29.52 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.22 
 
 		 608 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  29.22 
 
 		 507 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  29.7 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  27.51 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  28.12 
 
 		 599 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.17 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  26.18 
 
 		 605 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  27.04 
 
 		 586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  31.21 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.89 
 
 		 595 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  24.94 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  26.01 
 
 		 586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  30.5 
 
 		 481 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.87 
 
 		 456 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.03 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  30.89 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  31.29 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  31.45 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  27.23 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  30.93 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.31 
 
 		 521 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.23 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  29.95 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  31.61 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.59 
 
 		 513 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.59 
 
 		 513 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  27.16 
 
 		 590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  27.82 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  26.08 
 
 		 513 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  29.74 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  29.74 
 
 		 516 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  29.89 
 
 		 482 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  24.37 
 
 		 596 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  24.37 
 
 		 601 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  24.13 
 
 		 604 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  28.31 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  29.7 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  25.82 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  25.63 
 
 		 553 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  29.5 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  23.72 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  26.4 
 
 		 542 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  30.41 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  24.83 
 
 		 536 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  24.6 
 
 		 648 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  29.06 
 
 		 378 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  32.51 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  23.24 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  23.91 
 
 		 590 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.3 
 
 		 615 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  36.99 
 
 		 437 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  24.05 
 
 		 551 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  24.26 
 
 		 553 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.68 
 
 		 335 aa  93.6  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.42 
 
 		 568 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  19.47 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  21.85 
 
 		 480 aa  91.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  24.17 
 
 		 567 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  37.93 
 
 		 292 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  23.91 
 
 		 540 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  25 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  26.87 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  26.87 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  23.44 
 
 		 639 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  26.87 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  23.06 
 
 		 540 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  24.03 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  24.62 
 
 		 569 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  23.34 
 
 		 643 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>