More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08370  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 547 aa  1124    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3387  extracellular solute-binding protein family 5  46.04 
 
 		 550 aa  458  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2471  putative ABC transporter periplasmic binding protein  45.2 
 
 		 530 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1271  ABC transporter, periplasmic binding protein  44.53 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000259921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0188  extracellular solute-binding protein  46.88 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06680  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  43.09 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000372543  normal  0.255135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2145  extracellular solute-binding protein family 5  43.09 
 
 		 537 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0935  extracellular solute-binding protein family 5  36.69 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4082  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 562 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0360  extracellular solute-binding protein family 5  26.29 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 528 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 553 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  24.76 
 
 		 565 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 508 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.15 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0449  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 514 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.97 
 
 		 531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.14 
 
 		 510 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  32.09 
 
 		 513 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.7 
 
 		 512 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.7 
 
 		 512 aa  110  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.7 
 
 		 512 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.49 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.55 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.34 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.7 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.7 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.7 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0497  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00026016 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.7 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5711  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  26.39 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.36 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.95 
 
 		 522 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  23.19 
 
 		 541 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.36 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 515 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1603  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 539 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654936  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 503 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 509 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.17 
 
 		 516 aa  107  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.3 
 
 		 535 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 		 509 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 517 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2998  extracellular solute-binding protein family 5  29.1 
 
 		 610 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.869563  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 529 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0206  extracellular solute-binding protein family 5  28.95 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.58 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  24.23 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  25.82 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  26.99 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19540  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.394832  normal  0.058637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  26.76 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  28.3 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 508 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 526 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9144  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.6 
 
 		 507 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 506 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  24.88 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 489 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 519 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3647  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 556 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0862095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2014  twin-arginine translocation pathway signal  25.36 
 
 		 534 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.533924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 523 aa  103  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  31.47 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>