More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06220  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
234 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.433338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4805  ABC transporter related  62.5 
 
 
245 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3176  ABC transporter related  65.3 
 
 
269 aa  262  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  61.9 
 
 
238 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4159  ABC transporter related  60.18 
 
 
243 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.0446286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  61.78 
 
 
235 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0700  ABC transporter related protein  66.21 
 
 
242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1414  ABC transporter related protein  62.5 
 
 
238 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201089  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0829  ABC transporter related  60.96 
 
 
245 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.848546 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  41.33 
 
 
234 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  40.89 
 
 
234 aa  204  7e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.44 
 
 
235 aa  204  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  40.44 
 
 
234 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 
221 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  52.84 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.38 
 
 
225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.91 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  50.68 
 
 
252 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  50 
 
 
222 aa  198  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 
246 aa  198  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.58 
 
 
239 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  50.68 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  47.47 
 
 
222 aa  197  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  50 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  45.83 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  39.38 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  54.09 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.6 
 
 
653 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.5 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  49.54 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  49.77 
 
 
232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  41.44 
 
 
241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.89 
 
 
252 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.15 
 
 
228 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.16 
 
 
226 aa  194  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 
232 aa  193  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  52.21 
 
 
238 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  51.16 
 
 
230 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  47.03 
 
 
644 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  42.73 
 
 
238 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.37 
 
 
250 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  41.96 
 
 
241 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  40.99 
 
 
241 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
230 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.08 
 
 
642 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
236 aa  192  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  47.3 
 
 
226 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
227 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.23 
 
 
248 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  50 
 
 
660 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.74 
 
 
249 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
266 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
236 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
252 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
238 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  44.14 
 
 
224 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.17 
 
 
239 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  47.09 
 
 
225 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  45.95 
 
 
240 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  47.09 
 
 
225 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.79 
 
 
228 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.55 
 
 
227 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  45 
 
 
226 aa  190  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.52 
 
 
236 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.09 
 
 
253 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
230 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.04 
 
 
232 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 
224 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  43.38 
 
 
236 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.05 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.05 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  45.05 
 
 
648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.64 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  45.91 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  47.73 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  42.92 
 
 
226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  43.64 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.84 
 
 
230 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  48.28 
 
 
228 aa  189  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  42.2 
 
 
226 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.21 
 
 
252 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.69 
 
 
264 aa  188  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.38 
 
 
225 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  48.2 
 
 
305 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.37 
 
 
237 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  46.05 
 
 
269 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  43.52 
 
 
240 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>