More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4258 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.7 
 
 
754 aa  1413    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  53.36 
 
 
763 aa  716    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.17 
 
 
754 aa  1408    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.17 
 
 
754 aa  1406    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  93.91 
 
 
754 aa  1405    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.04 
 
 
754 aa  1406    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.75 
 
 
750 aa  936    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.17 
 
 
754 aa  1407    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.17 
 
 
754 aa  1406    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  88.21 
 
 
752 aa  1326    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  52.78 
 
 
759 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
755 aa  1507    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.5 
 
 
750 aa  897    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  93.91 
 
 
754 aa  1405    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  94.3 
 
 
754 aa  1417    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  52.78 
 
 
759 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  37.43 
 
 
735 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.89 
 
 
740 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.52 
 
 
856 aa  325  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  31.43 
 
 
759 aa  323  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 
761 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.99 
 
 
762 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.48 
 
 
839 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 
785 aa  307  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 
785 aa  306  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.22 
 
 
856 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 
849 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  31.54 
 
 
849 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.92 
 
 
848 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  29.74 
 
 
989 aa  301  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.62 
 
 
759 aa  301  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  31.95 
 
 
748 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
845 aa  292  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.4 
 
 
853 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.85 
 
 
844 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.68 
 
 
834 aa  283  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.91 
 
 
756 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.44 
 
 
991 aa  283  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.42 
 
 
844 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.13 
 
 
995 aa  277  4e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.39 
 
 
990 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.08 
 
 
844 aa  270  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  28.36 
 
 
900 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.94 
 
 
846 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  30.79 
 
 
734 aa  267  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  32.69 
 
 
1001 aa  263  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.17 
 
 
981 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.22 
 
 
1029 aa  260  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.49 
 
 
1055 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.36 
 
 
991 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.28 
 
 
996 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2102  protein-export membrane protein SecD  38.68 
 
 
433 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.459213  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  27.25 
 
 
977 aa  249  9e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.86 
 
 
995 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.06 
 
 
846 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  28.61 
 
 
855 aa  246  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  37.24 
 
 
403 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  36.43 
 
 
461 aa  241  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  26.4 
 
 
843 aa  239  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 
419 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.13 
 
 
753 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  36.5 
 
 
419 aa  234  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.69 
 
 
911 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  33.26 
 
 
470 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  35.64 
 
 
413 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  33.26 
 
 
470 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  38.18 
 
 
411 aa  223  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000572302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  28.32 
 
 
885 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  35.73 
 
 
423 aa  220  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  34.56 
 
 
464 aa  220  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.56 
 
 
858 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.85 
 
 
410 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  35.11 
 
 
416 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  32.39 
 
 
471 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.12 
 
 
406 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.62 
 
 
1400 aa  214  7e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  36.06 
 
 
411 aa  213  7e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  34.02 
 
 
415 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  32.58 
 
 
470 aa  209  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  44.1 
 
 
291 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  33.25 
 
 
461 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  27.72 
 
 
793 aa  208  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  34.38 
 
 
474 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  32.41 
 
 
399 aa  207  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  34.09 
 
 
403 aa  204  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  38.39 
 
 
308 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  34.36 
 
 
533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  31.46 
 
 
474 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  40.07 
 
 
280 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 
532 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  30.3 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  34.2 
 
 
533 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  30.75 
 
 
468 aa  197  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 
533 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  35.19 
 
 
449 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  34.98 
 
 
534 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  33.73 
 
 
533 aa  193  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  33.1 
 
 
533 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  29.85 
 
 
495 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  33.93 
 
 
531 aa  192  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>