More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0194 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  86.53 
 
 
193 aa  343  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  86.53 
 
 
193 aa  343  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  86.01 
 
 
193 aa  340  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  37.97 
 
 
195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
197 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
201 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
403 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
423 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
217 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
289 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 
210 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 
222 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
275 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  33 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
275 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
244 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
218 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
218 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
218 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  31.18 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 
280 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.47 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  42.47 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  42 
 
 
219 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  38.98 
 
 
181 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  39.29 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  39.29 
 
 
112 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  48.89 
 
 
208 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
243 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
198 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  38.33 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
223 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  38.33 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
324 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  48.89 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>