More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3599 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.53 
 
 
279 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.68 
 
 
292 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.19 
 
 
292 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0386501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.66 
 
 
295 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 
290 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.811922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.3 
 
 
290 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117314  hitchhiker  0.00259288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
282 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
305 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1230  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
295 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.419634 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0283  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 
299 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
296 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
302 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2418  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
296 aa  156  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
297 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
297 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0103868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
301 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  34.3 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
302 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 
297 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532841  normal  0.819978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3338  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
321 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.480465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 
300 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1499  UDP-galactose 4-epimerase  33.97 
 
 
293 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06398  UDP-galactose 4-epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00360)  29.97 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0550101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 
327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0451692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
315 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08350  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
295 aa  102  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1709  UDP-glucose-4-epimerase  33.99 
 
 
313 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.12 
 
 
312 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04680  hypothetical protein  29.57 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0908  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0682781  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.799707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0393697  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  33.89 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.48 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  33.7 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  32.78 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.22 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4447  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0155912  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.993557  normal  0.56488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  23.84 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.57 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  25.87 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  28.57 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.14 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  30.77 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.64 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  29.89 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0902  hypothetical protein  28.26 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16717  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118194  normal  0.0268185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1053  hypothetical protein  28.42 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  25.83 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  27.37 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.212771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  29.61 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.13414  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2509  UDP-glucose 4-epimerase  27.93 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3663  UDP-glucose 4-epimerase  28.5 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000129816  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0517  UDP-glucose 4-epimerase  26.83 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.79 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  30.08 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.19 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  26.33 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>