More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2081 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 223 aa  433  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  55.16 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  48.1 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4780  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.791563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  42.6 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  36.12 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0924  transcriptional regulator, HxlR family  37.33 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.787459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2233  HxlR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  36.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  50.46 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2326  HxlR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.503495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  51 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5238  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  46.46 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 110 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 110 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2199  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.69891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  43.14 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  42.34 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  47.31 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  47.31 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  27.52 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  47.31 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  47.31 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 148 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  46 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  52.17 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  43 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5213  transcriptional regulator, HxlR family  43.36 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1397  putative transcriptional regulator  34.91 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000300955  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  43.62 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  42 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  47 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl051  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  40.38 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  45 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  31.05 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  47.37 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  37.63 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  36.11 
 
 		 114 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.3 
 
 		 111 aa  74.3  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  48.94 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  41.41 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  41.11 
 
 		 137 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12340  predicted transcriptional regulator  43 
 
 		 125 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  36.45 
 
 		 114 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  35.9 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>