More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1926 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1926  peptidase M20  100 
 
 
447 aa  883    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1438  peptidase M20  62.04 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  49.66 
 
 
446 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1518  peptidase M20  49.08 
 
 
448 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0128232  decreased coverage  0.000123266 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0261  peptidase M20  43.08 
 
 
467 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  43.14 
 
 
453 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  43.14 
 
 
453 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  43.14 
 
 
453 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  40.86 
 
 
445 aa  316  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  42.23 
 
 
484 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  44.13 
 
 
453 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12543  hypothetical protein  43.82 
 
 
470 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0008278  hitchhiker  0.00719011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16280  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  41.15 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.78366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  42.08 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4666  Beta-Ala-His dipeptidase  43.71 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.976885  hitchhiker  0.00791318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  43.19 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  43.02 
 
 
472 aa  299  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  42.36 
 
 
460 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  43.09 
 
 
469 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6602  hypothetical protein  43.44 
 
 
449 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2534  hypothetical protein  42.6 
 
 
452 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403984  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  43.9 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0480  Beta-Ala-His dipeptidase  38.18 
 
 
453 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  43.85 
 
 
469 aa  279  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15560  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  40.09 
 
 
447 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.471223  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1881  peptidase M20  42 
 
 
464 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3301  hypothetical protein  40.27 
 
 
449 aa  276  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653299  normal  0.0124999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2219  peptidase M20  39.49 
 
 
476 aa  275  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0824  hypothetical protein  37.72 
 
 
455 aa  273  5.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  39.69 
 
 
488 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2089  peptidase M20  41.61 
 
 
464 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0408  peptidase dimerization domain protein  35.71 
 
 
455 aa  264  3e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3706  peptidase M20  42.99 
 
 
455 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.6 
 
 
465 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  35.37 
 
 
465 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  35.37 
 
 
465 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  36.24 
 
 
467 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  33.86 
 
 
456 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  29.72 
 
 
460 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  33.26 
 
 
458 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  30.09 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.07 
 
 
463 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  29.86 
 
 
453 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  28.99 
 
 
459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  31.26 
 
 
462 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  29.98 
 
 
456 aa  179  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  30.39 
 
 
455 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  30.56 
 
 
465 aa  177  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.88 
 
 
456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  30.16 
 
 
463 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  30.16 
 
 
440 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  30 
 
 
485 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  29.84 
 
 
452 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.11 
 
 
475 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  28.28 
 
 
451 aa  170  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  30.13 
 
 
465 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  30.53 
 
 
455 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  30.24 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  30.24 
 
 
457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  30.33 
 
 
456 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  30.16 
 
 
462 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  30.04 
 
 
457 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  26.58 
 
 
460 aa  160  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  30.39 
 
 
461 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  28.63 
 
 
459 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  30.65 
 
 
464 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  29.52 
 
 
457 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  29.92 
 
 
458 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  28.48 
 
 
463 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  29.13 
 
 
461 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  29.87 
 
 
462 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  29.89 
 
 
469 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  30.8 
 
 
474 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  29.32 
 
 
460 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  28.41 
 
 
461 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  29.76 
 
 
468 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  28.42 
 
 
462 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.93 
 
 
456 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  29.87 
 
 
460 aa  147  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  31.31 
 
 
468 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  28.48 
 
 
461 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  28.54 
 
 
463 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  26.88 
 
 
471 aa  144  4e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  28.12 
 
 
469 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  31.22 
 
 
488 aa  143  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  31 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  29.1 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  30.63 
 
 
460 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  27.71 
 
 
465 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  27.27 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  27.13 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  27.93 
 
 
468 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  30.79 
 
 
479 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  27.84 
 
 
458 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  28.64 
 
 
470 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  29.3 
 
 
461 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  27.88 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  28.42 
 
 
467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  27.88 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  29.07 
 
 
461 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>