164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6131 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  93.59 
 
 		 359 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  92.76 
 
 		 359 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 358 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  92.76 
 
 		 359 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  92.48 
 
 		 359 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  56.04 
 
 		 363 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  56.04 
 
 		 363 aa  348  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  55.77 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  55.77 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  55.77 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  55.77 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  55.77 
 
 		 363 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.24 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.16 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  21.24 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  31.25 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.98 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  27.78 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  24.91 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  28.72 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  27.18 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 399 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  33.12 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 276 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  23.4 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.95 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.56 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 272 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 250 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.45 
 
 		 280 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.87 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  46.43 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.57 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.07 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  25 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27 
 
 		 264 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 238 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.6 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  24.1 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  22.12 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  22.65 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.53 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 379 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 270 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.32 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>