More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1433 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  100 
 
 		 544 aa  1091    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  51.87 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  50.66 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  47.11 
 
 		 599 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  52.12 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  47.1 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  49.02 
 
 		 580 aa  455  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  49.9 
 
 		 570 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  49.11 
 
 		 559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  51.2 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  48.54 
 
 		 564 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  47.66 
 
 		 573 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  47.42 
 
 		 596 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  49.7 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  49.41 
 
 		 598 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  48.39 
 
 		 567 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  49.31 
 
 		 598 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  46.33 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  44.89 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  44.53 
 
 		 574 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  44.83 
 
 		 546 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  45.8 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  43.98 
 
 		 577 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  50.25 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  46.65 
 
 		 494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44.44 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 580 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.59 
 
 		 564 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.94 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.44 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.44 
 
 		 520 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.29 
 
 		 871 aa  346  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  45.37 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  47.55 
 
 		 578 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  45.58 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  43.25 
 
 		 571 aa  342  7e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 521 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.44 
 
 		 555 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.53 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.54 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  47.29 
 
 		 575 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.16 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.82 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  48.84 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  45.9 
 
 		 498 aa  337  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.59 
 
 		 585 aa  336  7e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  45.67 
 
 		 498 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  47.3 
 
 		 511 aa  335  9e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.94 
 
 		 568 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.68 
 
 		 561 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  47.67 
 
 		 501 aa  333  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.08 
 
 		 553 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  40.76 
 
 		 514 aa  333  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.33 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 586 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.69 
 
 		 563 aa  332  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.07 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 		 521 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.52 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 		 521 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 		 521 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.33 
 
 		 568 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.64 
 
 		 599 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  43.57 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.52 
 
 		 557 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.63 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  44.36 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  36.58 
 
 		 577 aa  329  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 584 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 556 aa  329  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  41.94 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.2 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  41.69 
 
 		 521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 573 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  46.6 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.81 
 
 		 571 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 573 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  46.6 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  46.6 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.79 
 
 		 571 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  41.99 
 
 		 521 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 545 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  42.53 
 
 		 497 aa  326  6e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  40.77 
 
 		 569 aa  326  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.55 
 
 		 553 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.98 
 
 		 567 aa  325  9e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  43.1 
 
 		 521 aa  325  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  38.82 
 
 		 577 aa  325  9e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.4 
 
 		 553 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>