129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0634 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1426 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  74.11 
 
 		 1368 aa  1985    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  73.82 
 
 		 1397 aa  2029    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  91.85 
 
 		 1399 aa  2559    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  74.82 
 
 		 1397 aa  2048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  60.23 
 
 		 1430 aa  1639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  92.14 
 
 		 1399 aa  2564    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 1398 aa  2779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  92.21 
 
 		 1399 aa  2565    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  73.74 
 
 		 1397 aa  2020    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  73.74 
 
 		 1397 aa  2020    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  73.82 
 
 		 1397 aa  2024    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  73.74 
 
 		 1397 aa  2024    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  74.11 
 
 		 1372 aa  1985    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  87.49 
 
 		 1399 aa  2430    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  92.07 
 
 		 1399 aa  2557    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  99.36 
 
 		 1398 aa  2765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  55.92 
 
 		 1419 aa  1570    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  60.06 
 
 		 1428 aa  1605    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1419 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1426 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 1426 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1398 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1381 aa  553  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1384 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1425 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1420 aa  482  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1378 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1441 aa  476  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1379 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  29.76 
 
 		 1472 aa  432  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.44 
 
 		 1384 aa  427  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1307 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1284 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1341 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1394 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1264 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.81 
 
 		 1379 aa  365  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  31.18 
 
 		 1450 aa  365  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1261 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1418 aa  275  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.8 
 
 		 1304 aa  211  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1277 aa  201  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1273 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1276 aa  189  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1141 aa  188  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1273 aa  187  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1288 aa  187  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1284 aa  178  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1276 aa  174  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1291 aa  172  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.11 
 
 		 1300 aa  162  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1286 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1283 aa  159  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1459 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1392 aa  158  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1287 aa  156  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1291 aa  157  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1419 aa  157  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1307 aa  157  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1274 aa  156  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1306 aa  157  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1441 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1266 aa  155  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1454 aa  155  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1446 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1307 aa  154  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1266 aa  154  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1266 aa  154  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.64 
 
 		 1266 aa  153  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 		 1266 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1266 aa  153  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1266 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1390 aa  152  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1436 aa  152  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1439 aa  152  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  25.13 
 
 		 1346 aa  151  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1266 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1301 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1305 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1309 aa  149  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1443 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1266 aa  147  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1383 aa  146  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1266 aa  145  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1417 aa  143  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1417 aa  140  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1266 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1266 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1266 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1153 aa  140  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1266 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1266 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1269 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.32 
 
 		 1273 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.82 
 
 		 1301 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.83 
 
 		 1283 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1271 aa  128  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1271 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1265 aa  123  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>